然而，正当图灵尽情发挥他的天才时，悲剧却突然降临：1952年1月，他遇到了一个流浪汉阿诺德·莫里，并将其带回自己的家中同居。可惜，这个莫里并不领情，顺走了图灵家的不少值钱的东西。图灵随即报警，而他是同性恋的隐情也因此被公开。
1952年3月31日，图灵因涉嫌“严重猥亵罪”(Gross indecency)出庭受审——当时的英国，同性恋面临两种选择：要么坐牢，要么接受化学阉割——当时人们认为同性恋源自过剩的雄性激素，可以通过注射雌性激素来“矫正”。
图灵选择了第二种——至少这样，他还能继续研究数学。经过长达一年的注射“治疗”，我们不知道图灵的同性恋究竟是否被“治愈”了，但是——这种所谓的“治疗”带来的副作用却是明显的：他的女性性征开始发育起来，甚至难以掩盖。而这一判决，也让图灵失去了安全许可证，丢掉了心爱的工作。这些，都让他无法再忍受下去。
