为悼念遇难同胞，南京人民于1985年修建了纪念馆，1995年又进行扩建。 建筑物采用灰白色大理石垒砌而成，气势恢宏，庄严肃穆。是一处以史料、文物、建筑、雕塑、影视等综合手法，全面展示南京大屠杀特大惨案的专史陈列馆。
该馆共分为外景展区、遗骨陈列、史料陈列三个部分。外景展区由群雕、立雕、浮雕、标志碑、纪念碑、诗碑、赎罪碑、枯树、断垣残壁、遇难者名单墙、绿树草坪等诸多景观，构成了生与死和悲与愤为主题的纪念性墓地建筑风格。
外形为棺椁状的遗骨陈列室内，陈列着建馆时从“万人坑”中挖掘出的部分遇难者遗骨，是侵华日军大屠杀的铁证。
呈墓穴形状且半地下的史料陈列大厅内，陈列着1000余件珍贵的历史照片、文物、图表和见证资料。
采用灯箱、沙盘、泥塑、油画、复原景观、多媒体触摸屏、电影电视等现代陈列手段，再现南京大屠杀的悲惨历史，揭露日本军国主义者的血腥暴行。
