考试内容
基因组导论
考试内容
基因组学的研究对象和发展历程
基因在DNA水平、RNA和蛋白质水平的定义
基因组的定义和基因组的分类
基因学研究的基本内容
基因组学研究的基本技术与方法
考试要求
了解基因组研究的基本对象、内涵和最新进展
了解基因的结构单元、功能单元和表型单元
了解基因组研究的基本方法：物理图谱的制作、DNA测序和注释
理解基因组组分变化的基本参数：GC含量、GC-skew、嘌呤含量
掌握基因组重复序列的分类(包括原核生物和真核生物)
2.遗传密码与基因组的进化
考试内容
遗传密码的发现
遗传密码的排列和内容导向的排列
RNA世界假说
遗传密码的进化
GC含量变化与密码子的动态关系
考试要求
记忆密码子表的密码子和氨基酸的排列
简述遗传密码中密码子排列的规律和基本关系
解释什么是RNA世界和了解细胞器的起源
举例解释密码子进化的假说
解释密码子或氨基酸变化与DNA组分动态变化的关系(原核生物基因组)
3.微生物基因组学
考试内容
真细菌基因组
古细菌基因组
极端环境微生物基因组
单细胞真核基因组
宏基因组
考试要求
全面了解真细菌基因组的结构和复制起始位点
全面了解古细菌基因组的结构和复制起始位点
了解细菌基因组的重复序列和极端环境微生物基因组的特点
全面了解横向转移的发生和对细菌基因组进化的意义
了解酵母基因组的大小和染色体的数量
4. 脊椎动物基因组学
考试内容
目前已经测定的脊椎动物基因组有哪些
灵长类基因组间的差异
哺乳动物Y染色体的进化
脊椎动物2R假说的内容和根据
脊椎动物基因数量的增加和基因大小的增加
考试要求
了解脊椎动物基因组中基因结构的特点
了解基因结构与重复序列的关系
列举种群特异的重复序列分类
了解脊椎动物基因组进化的基本动力
理解脊椎动物基因数量的概念
4. 节肢动物基因组
考试内容
昆虫基因组大小的变化范围和结构的特点
昆虫基因组重复序列与进化
节肢动物基因组结构与脊椎动物基因组的差异
昆虫基因组研究为模式生物研究提供了基本生物学基础
昆虫基因组研究与经典遗传学研究的关系
考试要求
了解昆虫基因组重复序列的种类
了解昆虫基因组大小的变化
节肢动物基因组研究的进展有哪些
以昆虫为模式的生物学研究内容有哪些
了解利用昆虫为模式的遗传学研究
5. 其他多细胞动物基因组和转录组研究
考试内容
线虫基因组
转录组研究
非编码RNA
小RNA的种类和定义
表观遗传学和甲基化
考试要求
了解线虫基因组和基因的结构特点
了解转录组研究的基本技术和方法
了解近年来非编码RNA和小RNA研究的进展
解释DNA甲基化和组蛋白修饰研究的方法
6. 植物基因组
考试内容
已经测序的植物基因组和植物基因组结构的特点
植物基因进化的原动力是基因组的重复(加倍)
植物基因组的共线性
杂交优势研究的理论
植物基因组研究的特点
考试要求
了解植物基因组结构的特点
熟悉植物基因组中的重复序列
植物基因组多倍体与基因组进化的关系
了解植物家养化过程中基因的变化
了解植物杂交优势的分子机理研究
了解植物基因组研究的最新进展(有哪些基因组的全序列是已知的)
7.人类基因能组研究
考试内容
人类基因组计划(理由、计划与实施)
人类基因组计划的后续工作
癌症和常见疾病的研究方法
全基因组关联性(Whole Genome Association)研究
人类基因组与灵长类基因组的基本差异
考试要求
了解人类基因组计划的历史
不同定义下人类基因组基因的数量
什么是SNP和HapMap计划
什么是全基因关联性研究和研究的基本方法
了解人类基因组研究的进展
8. 基因组研究技术与方法
考试内容
下一代基因组测序技术
基因测序技术的发展历史
发现和鉴定基因功能的方法
蛋白质组研究的基本方法和原理(如双向电泳和质谱)
蛋白质的功能域
考试要求
市场上有哪些“下一代”测序仪?
解释“下一代”测序仪的基本技术原理
了解基因标签的研究方法和数据分析原理
简述鉴定蛋白的基本方法
分析蛋白质功能域的方法
9. 基因组信息分析
考试内容
基因组信息研究与数据库
基因表达数据分析与数据库
基因的组装和重复序列识别
基因识别
DNA序列的进化分析
考试要求
了解国际主要数据库(如Genbank)和常用工具(如blast)
了解EST、序列标签(尤其是新一代测序仪产生的数据)和芯片数据等数据库的基本内容
了解基因组序列组装的基本原理
了解基因识别软件和原理(包括真核与原核生物基因组)
掌握DNA序列进化研究的基本方法和常用软件
主要参考书目：
序号/书名/作者/出版社/备注
1)基因组III;T.A.布朗;袁建刚(译);科学出版社。
2) 基因Ⅷ;本杰明·卢因;余龙、江松敏、赵寿元(译);科学出版社。
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