一般来说，博士阶段的奖学金机会比较多。如果是比较好的国立大学，博士阶段基本上都有奖学金。另外，留学生能够申请学费减免，越好的大学，留学生越少的大学，学费减免的机会越多。
关于公费，有一种日本政府发给的政府奖学金，称为国费，是最高待遇的奖学金。国费留学生(对应的是私费留学生)的待遇是，免学费，每月18万日元的生活补贴，每年提供回国往返机票两张。
国费的申请方法有两种，一种是通过你联系的日本教授申请。一种是通过中国留学基金委申请。后一种方式要求学历硕士，请经常关注基金委网站。另外也有其他各种种类的奖学金，如日本政府文部科学省博士生奖学金项目。
