2015中国科学院北京基因组研究所《生物信息学》考研大纲

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　　2015中国科学院北京基因组研究所《生物信息学》考研大纲

　　《生物信息学》考试大纲

　　本《生物信息学》考试大纲适用于中国科学院大学报考生物信息学专业的硕士研究生入学考试。生物信息学是一门研究生物和生物相关系统中信息内容和信息流向的综合性科学。它采用信息科学、计算机科学、生物数学、比较生物学等学科的观点和方法对生命的现象及其组成分子(核酸、蛋白质等)进行研究，主要研究生命中的本质和规律，包括物质组成、结构功能、生命体的能量和信息交换传递等。通过对生物信息的计算处理，人们能从众多分散的生物学观测数据中获得对生命运行机制的详细而系统的理解。

　　考试内容

　　★ 生物信息学概论和数据库

　　★ 序列数据的收集和存储

　　★ 基因组序列组装和基因注释

　　★ 基因结构元件识别和分析

　　★ 双序列与多序列比对

　　★ 数据库检索算法

　　★ 序列变异研究的算法与进化分析

　　★ 数据可视化

　　★ 基因表达与调控网络

　　★ 表观遗传学数据分析

　　★ 蛋白质分类与结构预测

　　考试要求

　　★ 了解生物信息学概念、研究方向、发展趋势和重要事件，包括泛基因组和元基因组的概念，第一个全基因组序列和第一个基因组数据库的产生等。

　　★ 了解重要的生物信息中心和常用数据库(包括DNA序列数据库、基因组数据库、蛋白质序列及结构数据库)

　　★ 了解不同类型序列数据的获取方式，掌握常用的序列存储格式及转换方式。

　　★ 掌握常用序列联配算法及软件，了解打分矩阵及空位罚分算法。

　　★ 理解多重序列比对与进化分析的关系，掌握常用渐进算法及软件。

　　★ 掌握FASTA和BLAST系列算法。