1、通过外务省（在外日本公使馆）可以申请奖学金的方法
通过外务省（在外日本公使馆）可以申请各项奖学金。但因申请对象的国家地域不同，具体请到当地日本使馆咨询。
第一次选拔有书面材料审查，笔试，面试组成。笔试科目因国家、地域不同，请参考下表：
| 种 类 | 科 目 |
| 研究留学生 | 日语 英语 |
| 教员研修留学生 | 日语 英语 |
| 专修学校留学生 | 数学 英语 日语 |
| 学部留学生 | 日语 英语 数学 理科（化学、物理以及生物中的一科） |
| 高等专门学校留学生 | 数学 物理以及化学 日语 英语 |
| 日语 日本文化研修留学生 | 日语 |
在外公使馆根据以上考试结果，将候选人推荐到日本文部科学省。文部科学省通过与选拔委员会接受校协商（除已获得入学许可的研究留学生）决定最终的合格者。关于留学学校的选择，候选人可以提出申请，但最终由文部科学省决定。申请材料、手续等，请向最近的日本使馆咨询。
2、通过日本的各大学申请的方法
A.留学生赴日前申请奖学金的情况下（大学推荐）
国内的大学通过大学间交换留学项目申请政府奖学金的外国留学生，通过国内大学的审查，作为研究留学生以及日语 日本文化研修留学生向文部科学省提出申请，文部科学省与选拔委员会协商决定申请合格者。具体信息请到你所在学校查询。
B.在日自费留学生申请的情况下（国内申请）
以日本的各大学在籍的自费留学为对象。4月新学期时，学部3年级希望继续攻读学部4年纪的学生（医学、牙学、兽医学以及6年制药学专业5年纪希望继续攻读学部6年纪的学生）希望继续攻读研究生的正规留学生。在籍的正规研究留学生博士。作为新学年的学部留学生或者研究留学生申请奖学金，从以上的留学生中选拔学习成绩优秀者。
申请者通过第一次选拔之后再参加由日本文部科学省组织的第二次选拔，由此决定最终合格者。大致的流程参考下表：
此外，参加青领导者项目的留学生，由各国推荐并向在外日本使馆提出申请。第一次选拔由各接收校组织自恋审查。面试。小论文考试等。最终经过青年领导者项目推进协会的第二次选拔，由文部科学省决定最终的合格者。
