1903年4月京都帝国大学的分部京都帝国大学福冈医科大学成立，这就是九州大学的前身。当时由于国家百废待兴，从财政、购地、校舍建筑各方面均力不从心，所以在8年之后也就是1911年方正式挂出九州帝国医科大学，同时还设有九州帝国工科大学，这是今天九州大学能成为综合性大学的基础。1947年改名为九州大学。1949年，包含位于福冈地区的旧制九州大学，再加上九州大学附属医学专门部、福冈高等学校、久留米工业专门学校成为新制的九州大学。
九州大学的超导、等离子体有关部门积极加入了这一重大工程的研究。另外，在海洋、火山、地震预测方面，九州大学在日本西部九州地区有完善的预测网。在癌的研究上，生医所已就癌的致因、诊断、治疗等方面与其它大学合作，取得了可喜的进展。九州大学历来有良好的学风，治学严谨，重视学生的实习和实践，教师重视启发式教学，毕业生十分受用人单位欢迎。可以毫不夸张地说，今天的九州大学已名副其实地成了日本西部地区一所举足轻重的高等学府。
九州大学校区相对比较集中，除了一些附属研究设施和实习基地，如农场、林场、海洋火山观察所等分布于九州及九州以外地区，教学、研究、行政基础设施均在福冈市内。为了追赶新技术革命的迅猛发展形势，日本政府近来把能源、宇宙科学、癌三大重点尖端研究项目交给基础雄厚的几所国立大学进行，九州大学亦是其中之一。比如在室内核聚变进行新能源开发这一项目中，日本政府每年不惜投资100亿日元用于设备改造和加强研究力量。
学校沿革
1903年 福冈医科大学设立(京都帝国大学之分科大学)
1911年 九州帝国大学设立
1911年 九州帝国大学工科大学官制施行，以分科大学设立医科大学工科大学
1919年 帝国大学令修改，各分科大学改制为医学部与工学部，并设立农学部
1924年 设立法文学部 招收二名女学生
1947年 更名为九州大学
1949年 法文学部改组，后成为文学部、法学部、经济学部、文学部，并从教育学部分离；福冈高等学校、久留米工业专门学校、旧制九州大学统合后成为新制九州大学及各分校 1953年 新制大学院(研究所)设置
1963年 分校经改组 设立教养部
1968年 九州艺术工科大学创立(现九州大学艺术工学部)
1997年 医学系研究科与工学研究科开始“大学院重点化”
2000年 大学院重点化之完成 同时引进学府、研究院制度，大学院(研究所)的所有研究科皆改组为研究院与学府
2003年 与九州艺术工科大学并校，成立艺术工学研究院、艺术工学府、艺术工学部
2004年 国立大学法人化，正式废除九州艺术工科大学，并设立法务学府
学费减免制度
入学费减免
本科, 研究生院(硕士 博士 前期)的学生，成绩优异且因不得已的理由不能支付入学费，可申请减免。经审核后，可享受全额或者半额的减免。入学费减免由各个院系的留学生事务负责人负责。想要申请入学费减免的学生请到所属学院的留学生事务负责人处申请。
研究生，专修生，听讲生不享受上述减免。
学费减免
入学后，成绩优异且因不得已的理由，不能支付入学费的学生，可申请减免。经审核后，可享受全额或者半额的减免。学费减免由留学生事务负责人负责。想要申请的学生请到所属学院的留学生事务负责人处申请。
