合伙人协议合同是在商业合作中起到关键作用的文书。它主要是为了明确商业合作双方的权利与义务，避免合作中产生的矛盾和纠纷。要写出一份有效的合伙人协议合同，必须要注意以下核心要素：
1、合作事项和合作方式
合作事项应当清晰明确，包括每方在合作中的分工、职责、权利和义务等内容。同时，需要明确合作方式，即合作期限、分成比例、账务核算方式等。
2、风险及利润分配方式
合伙人协议合同中也需要明确各自承担的风险和利润分配方式。例如，应当规定风险分担比例，及损益分配比例等。这样做可以避免未来因合作发生纠纷而无法协商或解决。
3、合作期限及终止条件
合伙人协议合同必须要规定合作期限，并标注相关终止条件。例如，可以规定合作期限为几年，或按照项目进行区分；同时，也需要规定合作终止的条件和方式，以充分保障各方的利益。
4、保密和知识产权权益
保密及知识产权权益也是合伙人协议合同中的重要要素。应明确保密内容、保密期限等。对于知识产权权益，应解释相关权益的所有权问题、许可协议、争议解决等。
总之，一份有效的合伙人协议合同应当简洁明了，能够明确表述商业合作中各方的权利及义务，并防止因合作过程出现的纠纷。