原因:
1. 政府违反了中央的土地政策，一些地方领导干部缺乏尊重公已财产权的意识,可以不给甚至不给农民土地补偿费，以权谋私，已经进入了犯罪的范畴
2. 土地征用补偿制度不健全
首先，行政补偿法律体系不健全。我国宪法规定了国家为了公共利益的需要，可以依照法律规定对土地实行征用，但未规定应给予响应的补偿。与宪法此规定相配套的法律规范对于补偿制度的规定也不完备。其次，补偿办法规定不合理、不科学，在实践中的可操作性较差。 具体表现在以下几个方面：
(一) 宪法法对补偿未作明确规定
(二) 补偿立法漏洞较多 ，层次繁杂
(三) 政府单方定价导致补偿标准不合理
(四) 补偿金发放程序存在缺陷
(五) 土地产权不明晰,行政法制监督制度不健全
(六) 基层民主制度不够 完善，干部考核机制不合理
(七) 土地税费制度不适当
3. 群众法律意识还不够强，在土地征用过程中往往遭到不同程度的侵害与剥夺
4 .征地程序中欠缺有效的监督机制，致使农村土地流失严重
由于在征用程序上缺乏有效的监督机制，很多时候便会出现政府擅自占用土地、买卖土地等非法转让土地和越权审批，或先征后批，或以合法形式掩盖非法占地的现象。由于农村土地征用费低，很多土地在被征用后由于种种原因被闲置，造成了大量土地资源的浪费，致使农村土地流失严重
5.欠缺合理的司法救济途径，土地纠纷不能得到很好的解决和处理
现行土地征用立法中对裁决征地纠纷的规定过于原则，往往导致纠纷无法解决，失地农民告状无门。即使是法院受理，由于征地制度本身的缺陷，老百姓也很难胜诉，其正当权益也很难得到维护。
对策:
1.政府应该着手开展的工作:
(一) 完善征地补偿办法，中央制定全国统一最底标准，地方因地制宜按照土地综合利用和实际年产值制定地方标准，但地方标准不得低于国家标准；在征地补偿费是否统一管理问题，中央不适宜制定统一行为，可放权让地方自行落实，制定省级地方性法规，但资金要专户、专项、核算审计、公开、协商一致，另外，村民民主讨论后可以决定该资金的合理使用
(二) 建立失地农民保障基金，对失地农民进行劳动技能培训，创造就业条件,引导农民实现再就业，妥善安置幼、老、伤残的社会保障问题；逐渐规范征地审批前听证制度、批前告知和确认制度的建设，切实维护农民的知情权、参与权、申诉权和救济权
(三) 政府主管部门负起责任，加强土地征用补偿与安置监管机制，防止征地款项被农村基层干部贪污挪用，补偿金不能完全到达失地农民手中
(四) 尽快制订土地征用管理办法单项法规，使征地行为有法可依
(五) 改革和完善地方领导干部的政绩考核制度,将保护耕地、维护农民权益纳入考核领导干部政绩的指标，防止因片面追求经济增长、搞形象工程乱占耕地，侵害农民权益
(六) 完善村级民主制度，凡涉及处置集体土地所有权的管理事项，必须经村民大会或村民代表大会讨论决定
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